Родился в 1912 году в деревне Шелковниково Болотинского района Новосибирской области. После окончания начальной школы переехал на станцию Тайга, работал угольщиком на складе.

В 1934 году был призван на действительную службу в Красноярск. Затем окончил полковую школу в городе Ачинске и снова продолжал служить в Красноярске. В 1943 году уехал на фронт.

Погиб 1 января 1945 года при освобождении города Будапешта.

Командир батальона 1-то стрелкового полка 99-й стрелковой дивизии лейтенант Забобонов в ночь с 4 на 5 декабря 1944 года получил боевой приказ на форсирование Дуная и захвата плацдарма на правом берегу реки. Несмотря на сильный артиллерийский, минометный и ружейно-пулеметный огонь противника, батальон первым в дивизии форсировал Дунай.

При достижении правого берега реки бойцы сломили упорное сопротивление противника и успешно закрепились на указанном рубежа. В этот день И. С. Забобонов со своим батальоном отразил несколько яростных контратак вражеской пехоты, поддержанной большим количеством танков, самоходных орудий и авиации. В этом бою батальон уничтожил до 250 солдат и офицеров противника.

За своевременное форсирование батальоном Дуная и захват плацдарма на правом берегу реки И. С. Забобонов достоин присвоения звания Героя Советского Союза.

Из копии наградного листа.

Погиб Иван Семенович 1 января 1945 года при освобождении Будапешта. В пригороде венгерской столицы Диошиде И. С. Забабонову установлен памятник.

Улица Забобонова И.С.

Ул. Забобонова находится в Октябрьском районе города, на его самой западной окраине (Тысячекоечная больница). Современный микрорайон: 9-ти этажные дома, просторные дворы. Посредине улицы широкая магистральная дорога, тротуары, элементы озеленения. Улица соседствует с западным природным комплексом.