Родился 10 августа 1918 года в Деревне Новоселы Ачинского района. После окончания пяти классов работал в колхозе «Великий перелом».
В Советской Армии с сентября 1938 года.
На фронте с 22 октября 1941 года.
1 октября 1943 года погиб смертью храбрых. Звание Героя Советского Союза присвоено посмертно.
Похоронен в деревне Шульговка Днепропетровской области.
При форсировании и переправе через реку Днепр командир саперного взвода 252-го отдельного мотоинженерного батальона младший лейтенант Водяников проявил образцы смелости, мужества и геройства. Водяников возглавлял инженерную разведку и первым прорвался на берег с целью захвата переправочных средств противника. В огневой и рукопашной схватке им захвачено пять рыбацких лодок врага. До подхода наших передовых частей младший лейтенант под немецким автоматным огнем за 15 минут собрал и снарядил доставленные его взводом десантные лодки А-3.
25 сентября 1943 года в 20.00 эти лодки с автоматчиками на борту первыми начали форсировать Днепр. Под ураганным огнем врага А. В. Водяников провел две лодки А-3 с десантом и высадил его на правом берегу, несмотря на пробоины и наличие раненых. Младший лейтенант Водяников возглавлял десантников в рукопашной схватке и удерживал плацдарм до прихода очередных десантов.
26 сентября 1943 года в 5.00 Водяников, командуя паромом, переправлял через Днепр две 76-миллиметровые пушки. В 30 метрах от правого берега снаряд пробил одну из лодок. Паром стал погружаться в воду. Тогда младший лейтенант прыгнул за борт, вплавь доставил паром к берегу и отлично произвел разгрузку орудий.
В последующих десантных перевозках Водяников героически погиб при выполнении своих обязанностей.
Из наградного листа.
Похоронен в посёлке Кринички, Днепропетровской области.
Приказом Министерства внутренних дел СССР зачислен навечно в списки личного состава Центрального РОВД г.Красноярска. Возле здания, в котором размещается отдел, установлен бюст Героя.
Улица Водяникова А.В.
(бывшая 3-я Дальневосточная) Центральный район
Ул. Водяникова находится в Покровке (в её северо-западной части), имеет значительную протяженность по направлению с востока на запад. Торцами к данной улице обращены 1,3,5,7и 9 Продольные улицы. Застроена типичными для подобных городских слободок домами усадебного типа. Дома добротные, обшиты тесом, с палисадниками, глухими заборами. Проезжая часть асфальтирована, тротуаров нет. Есть несколько усадеб с современной застройкой по типу коттеджей.